威斯康星大学是一个由多所州立大学构成的大学系统即“威斯康星大学系统”（University of Wisconsin System），同时威斯康星大学又常指坐落于威斯康星州首府麦迪逊市的威斯康星大学麦迪逊分校。与加利福尼亚大学、得克萨斯大学等美国著名公立大学系统一样威斯康星大学系统由分布于威斯康星州各地的13所公立大学组成。
威斯康星大学麦迪逊分校下属20个学院。除了传统的本科和研究生院系如商业、工程、教育、农业和文理外，它还设有法学院、医学院、兽医学院和药学院。文理学院由39个系和5个职业学院组成，是大学中最大的一个学院。它承担了在生物、天文、历史、地理和社会学等广泛领域的教学和研究任务。几乎一半的本科生属于文理学院。本科生入学后如果要进入专门的学院，需要进行额外申请。
博士学位研究型大学：
威斯康星大学麦迪逊分校(Madison)
威斯康星大学密尔沃基分校（Milwaukee）
学士、硕士学位大学：
威斯康星大学欧克莱尔分校（Eau Claire）
威斯康星大学绿湾分校（Green Bay）
威斯康星大学拉科罗斯分校（LaCrosse）
威斯康星大学奥史寇士分校（Oshkosh）
威斯康星大学肯若辖：帕克赛德分校（Kenosha：Parkside）
威斯康星大学柏拉特维尔分校（Plateville）
威斯康星大学河瀑分校（River Falls）
威斯康星大学史第分普颖特分校（Stevens Point）
威斯康星大学麦模尼：斯托特分校（Memominee：Stout）
威斯康星大学苏必略分校（Superior）
威斯康星大学白水市分校（Whitewater）
综合学院：
威斯康星大学芭拉布/撒欧克县分校（Baraboo/Sauk County）
威斯康星大学巴龙县分校（Barron County）
威斯康星大学方杜拉克分校（Fond du Lac）
威斯康星大学狐谷分校（Fox Valley）
威斯康星大学马尼托沃克分校（Manitowoc）
威斯康星大学马拉忪县分校（Marathon County）
威斯康星大学马莉那特分校（Marinette）
威斯康星大学泽田/活地县分校（Marshfield/Wood County）
威斯康星大学烈治兰分校（Richland）
威斯康星大学洛矶县分校（Rock County）
威斯康星大学树柏根分校（Sheboygan）
威斯康星大学华盛顿县分校（Washington County）
威斯康星大学华基沙分校（Waukesha）
威斯康星大学在线分校（Online）
威斯康星扩展教育部（UW-Extension）